O Programa de Desenvolvimento Institucional, sediado em Salvador (BA), foi criado para organizar as capacidades internas, sistematizar e disseminar experiências e metodologias, cuidar do conhecimento construído e integrar os programas locais. O Programa atua como suporte político-institucional, administrativo, financeiro e metodológico, além de buscar a articulação da instituição com os espaços de discussão e elaboração de políticas públicas a nível estadual e nacional.